Alytaus kraštotyros muziejuje yra 25 etatai: direktorius, du direktoriaus pavaduotojai, vyr. buhalteris, rinkinių vyr. saugotojas, 3 struktūrinių padalinių vedėjai, 5,75 muziejininkai, 3,75 kiti darbuotojai, 7,5 aptarnaujančio personalo darbuotojai.
Alytaus kraštotyros muziejaus darbuotojų vidutinis atlyginimas (neatskaičius mokesčių) 2012 metais:

Pareigybės	Pareigybių sk.	2012 m.
Direktoriaus pavaduotojai	2	1586 Lt
Struktūrinių padalinių vedėjai	3	1553 Lt
Muziejininkai	5,75	1323 Lt
Kiti darbuotojai	3,75	1270 Lt
Aptarnaujantis personalas	7,5	800 Lt

 
2011 metų muziejaus darbuotojų darbo užmokestis