Šiuo metu archeologijos rinkinyje sukaupta daugiau kaip 40 tūkstančių muziejinių vertybių. Seniausios muziejinės vertybės – titnaginiai dirbiniai iš Varėnos rajono (Dubičių, Rudnios, Kaniavos, Girežerio kaimų, Senosios Varėnos), taip pat rasti prie Ūlos ir Merkio upių. Pastaraisiais metais rinkinys pildomas muziejinėmis vertybėmis, atvežtomis iš žvalgomųjų archeologinių tyrimų, bei gautomis iš Kultūros paveldo departamento prie Kultūros ministerijos Alytaus–Marijampolės teritorinio skyriaus.
Naujausios vertybės atkeliavo iš 2023–2024 metais vykdytų archeologinių tyrimų Alytaus dvarvietėje (Šilelio gatvėje). Tarp jų – monetos, vario lydinio žetonas ir balta metalo danga padengta saga, atskleidžiantys dvarvietės istoriją ir anuometinio gyvenimo detales.
