Alytaus kraštotyros muziejuje yra 25 darbuotojų etatai.
Muziejaus darbuotojų vidutinis mėnesinis bruto darbo užmokestis:
| Pareigybės pavadinimas | 2017 m. I ketvirtis | 2017 m. II ketvirtis |
| Direktoriaus pavaduotojai | 614 | 689 |
| Skyrių vedėjai | 647 | 675 |
| Muziejininkai | 643 | 652 |
| Kiti kultūros darbuotojai | 620 | 638 |
| Aptarnaujantis personalas | 388 | 396 |
